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诚信经营质量保障价格合理服务贴心做细胞电转时,很多实验人员都会遇到一个很现实的问题:明明按照已有方案操作,电转结束后检测发现阳性率很低,甚至几乎看不到明显表达。
于是第一个想到的办法往往是:是不是电压太低了?要不要继续增加电压?
实际上,电转效率低怎么办,并不能简单归结为“电压不够"。电穿孔本质上是利用电脉冲让细胞膜在短时间内形成瞬时孔道,使质粒DNA、RNA、蛋白或者其他分子进入细胞。最终效率受到细胞状态、样品质量、电参数、电转体系、电极状态以及电转后恢复条件等多个因素共同影响。
如果没有找到真正的问题,仅仅提高电压,很可能出现另一种结果:转染效率没有明显提升,但细胞死亡上去了。
在排查电转效率之前,建议首先检查细胞。
很多实验失败并不是设备或者参数的问题,而是细胞在进入电转步骤之前,状态已经不理想。
例如连续培养时间过长、细胞过度融合、消化时间太久、细胞状态不均一,或者刚经历冻存复苏,都可能影响电转表现。
对于原代细胞、干细胞、免疫细胞等比较敏感的样品,这种影响往往更加明显。
如果同一套参数之前可以获得不错的结果,而最近突然下降,就应该首先回头检查细胞培养状态,而不是马上调整设备参数。
以质粒电转为例,DNA纯度、浓度和完整性都会影响最终结果。
如果质粒样品中盐离子、蛋白或者其他杂质偏高,在电转过程中可能影响体系电导率,甚至造成放电异常。
RNA、mRNA等样品同样如此。
还有一种常见情况是:为了提高效率不断增加核酸加入量。
但核酸并不是越多越好。
当核酸量超过适合的范围之后,不仅不一定继续提高转染率,还有可能增加细胞负担,影响存活率。
因此,遇到“电转效率低怎么办"这个问题时,可以把核酸用量设计成几个梯度,而不是一次性大幅增加。
电转参数并不是独立存在的。
例如提高电压通常可以增强细胞膜通透性,但同时也可能增加细胞损伤;延长脉冲时间可以增加电场作用时间,但过长同样可能降低细胞活率。
对于方波电穿孔,还需要考虑脉冲宽度、脉冲次数和间隔时间。
对于指数衰减波,则需要综合关注电压、电容、电阻以及最终形成的时间常数。
因此真正有效的参数优化,通常不是“一个参数一个参数乱试",而是在一个合理范围内建立参数矩阵。
例如在相邻电压范围内选择3个梯度,再结合2—3个脉冲时间进行小规模测试。
这样往往比一次次凭经验修改参数效率更高。
很多实验人员关注设备设置,却忽略了电转杯。
实际上,电极间距直接关系到电场强度。
相同电压条件下,不同间隙的电转杯形成的电场条件并不一样。
如果更换过电转杯规格,却仍然沿用以前的参数,实验结果就可能发生明显变化。
另外还需要检查电转体系总体积是否符合当前电转杯和实验方案要求。
样品体积过大、过小或者细胞悬液不均匀,都可能影响重复性。
有些实验实际上已经完成了有效递送,但是由于电转之后细胞恢复不好,最终检测时看到的阳性细胞数量仍然很低。
因此需要把“递送效率"和“最终活细胞阳性率"区别开。
电转之后是否及时加入恢复培养基、培养基温度是否合适、细胞是否长时间停留在电转杯中,以及检测时间点是否合理,都可能影响最后的数据。
尤其是脆弱细胞,电转结束后的几分钟往往非常重要。
优化电转实验时最容易犯的错误之一,就是只盯着转染率。
例如:
方案A转染率70%,细胞活率30%;
方案B转染率55%,细胞活率85%。
从真实实验角度来看,方案B可能反而更有价值。
所以建议优化时至少同时记录阳性率、细胞存活率、细胞数量和实验重复性。
如果涉及功能实验,还需要进一步观察后续细胞功能是否正常。
电转效率低怎么办?
真正有效的方法并不是简单增加一个参数,而是按照“细胞状态—核酸质量—电转体系—脉冲参数—电转杯—恢复条件"的顺序逐项排查。
如果实验已经进行了很多轮,参数越调越乱,可以先把每一次电转的细胞类型、细胞数量、核酸类型、核酸用量、电压、脉冲宽度、次数、电转杯规格、转染率和活率全部整理出来。
很多时候,把这些数据放在一起之后,问题会比继续盲目试参数更容易找到。