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诚信经营质量保障价格合理服务贴心不少实验室优化电转条件时,采用的是一种非常典型的方法:
第一次效果不好,加一点电压。
第二次死亡率太高,又把电压降下来。
第三次改变脉冲时间。
第四次再增加DNA量。
经过十几轮之后,做过很多实验,但仍然说不清楚到底哪一个因素影响最大。
这其实也是为什么“电转效率低怎么办"会成为很多科研人员反复遇到的问题。
问题不一定出在不会做实验,而是缺少一套系统化的优化方法。
首先需要明确实验最终想要什么。
如果只是暂时表达一个荧光蛋白,可能更加关注短期转染率。
如果做CRISPR基因编辑,最终关注的可能是编辑效率。
如果进行原代细胞或者免疫细胞处理,还需要重点考虑细胞活性和后续功能。
不同项目的“最佳电转条件"并不一样。
例如:
一个方案阳性率达到80%,但细胞活率只有40%;
另一个方案阳性率65%,活率达到85%。
对于很多需要继续培养或者功能验证的实验来说,第二种方案往往更加实用。
所以优化之前应该先确定:什么结果才算成功。
电转过程中可以调整的变量很多:
细胞数量、核酸量、电压、脉冲宽度、脉冲次数、脉冲间隔、电转缓冲液、电转杯间隙以及恢复条件。
如果一次同时修改五六个参数,即使结果明显改善,也无法知道到底是哪一个改变起了作用。
因此更有效的方法,是固定大部分条件,只测试1—2个关键变量。
例如第一轮重点寻找电压范围。
第二轮在合适电压附近优化脉冲时间。
第三轮再对核酸量进行优化。
这样整个实验逻辑会非常清楚。
假设参考文献中的参数是1200V。
很多实验人员会直接测试1200V一次。
效果不好以后,就判断“这个方案不适合"。
实际上更合理的方式是把1200V作为中心条件,例如测试1000V、1100V、1200V、1300V几个相邻水平。
如果数据显示:
1000V效率25%,活率92%;
1100V效率42%,活率88%;
1200V效率61%,活率78%;
1300V效率65%,活率48%。
这时候趋势已经非常明显。
真正值得继续优化的范围很可能就在1100—1200V附近,而不是继续向更高电压推进。
这就是参数梯度的价值。
电转优化其实是在寻找一个窗口。
电脉冲过弱,细胞膜通透性不足;
电脉冲过强,又会造成明显细胞损伤。
因此很多细胞都会存在一个相对合适的区域。
建议每次实验都把转染率和细胞活率放在一起观察。
如果效率升高的同时活率出现快速下降,就说明已经逐渐接近细胞耐受极限。
此时继续提高刺激强度的价值可能已经不大。
建议每一次电转至少记录:
细胞名称和批次;
培养状态;
细胞数量;
核酸类型和用量;
电转液;
电转杯规格;
电压;
脉冲宽度;
脉冲次数;
是否出现异常放电;
电转后恢复方式;
最终转染效率;
细胞存活率。
连续记录10—20次以后,你会拥有一套属于自己实验室的数据。
这类数据通常比互联网上随便找到的一组推荐参数更加有价值。
当实验已经进入长期项目阶段,除了寻找最佳参数,还需要考虑设备是否能够稳定重复输出实验条件。
尤其在进行大量样本、长期课题或者多个实验人员共同操作时,如果每一批数据波动明显,就会增加后续分析难度。
因此在设备选择和实验方案设计阶段,可以重点关注设备的电压范围、脉冲时间设置能力、波形类型、参数调节精度、程序保存以及实验记录便利性。
真正适合长期科研使用的电转方案,不应该依赖某一次“碰巧成功"。
所以当你再次遇到电转效率低怎么办,不妨把思路从“我要找到一个神奇参数",调整成“我要找到一个稳定参数窗口"。
前者追求一个数字,后者建立的是一套可以长期复现的实验方法。