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诚信经营质量保障价格合理服务贴心CRISPR基因编辑实验中,电转是一种常见的递送方式。
无论是质粒、mRNA还是Cas9蛋白与sgRNA形成的RNP复合物,都可以根据实验体系采用电转进行递送。
但实际操作中,很多实验人员会遇到一个问题:电转以后细胞看起来正常,甚至能够检测到一定递送信号,但最终基因编辑效率却没有达到预期。
这时候就不能简单把问题归结为“电转效率低"。
CRISPR实验至少可以拆成几个过程:
首先是材料进入细胞;
随后Cas9与sgRNA正常发挥作用;
再产生目标位点切割;
最后由细胞自身修复机制完成相应编辑。
电转主要影响的是递送环节,但最终编辑效率还会受到sgRNA设计、Cas9活性、目标位点状态以及检测方式等多方面影响。
因此,看到编辑效率低时,应先判断问题究竟出现在递送端还是编辑端。
如果连递送材料都很难进入细胞,重点应该优化电转条件。
如果递送本身没有明显问题,却始终得不到理想编辑结果,则需要进一步检查CRISPR体系本身。
不同形式的CRISPR材料,在细胞内发挥作用的路径不同。
例如,RNP复合物进入细胞后可以较快参与编辑;mRNA需要先完成翻译;质粒则还涉及进入细胞核以及后续表达。
因此,同一种细胞使用不同递送材料时,不应该简单认为原来的参数一定继续适用。
实验条件变化以后,最好重新进行小范围验证。
尤其是在从质粒体系转换到RNP体系时,除了电脉冲参数,还应同步关注材料用量、细胞数量以及电转后恢复条件。
为了提高CRISPR递送,有时会增加电刺激强度。
但对于原代细胞、T细胞、NK细胞等相对敏感的细胞,如果刺激过强,虽然部分细胞能够获得较高递送效率,但总体细胞数量可能明显下降。
对于后续需要扩增、筛选或者进行功能验证的实验,这种结果未必理想。
因此可以同时记录:
电转后短期存活;
CRISPR材料递送表现;
最终编辑效率;
编辑后细胞数量;
后续功能状态。
只有最后能够获得足够数量、状态正常并完成目标编辑的细胞,整个实验才真正具有实际价值。
CRISPR实验本身变量就很多。
如果一次同时更换sgRNA、改变Cas9用量、调整电转参数、改变培养体系,最后即使结果变好,也很难判断到底是哪一步发挥了作用。
更合理的方法是把问题拆开。
例如先确定当前递送条件是否稳定,再优化CRISPR体系;或者在CRISPR体系已经验证有效的情况下,集中比较不同电转条件。
这样得到的实验结果更容易重复,也更容易形成后续能够长期使用的标准流程。
因此,CRISPR电转真正需要解决的并不是单独追求“高效率",而是把递送、编辑和细胞状态结合起来看。