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8-27
有些电转实验最让人头疼的地方,并不是第一次失败。而是已经做了五次、十次,甚至更长时间,结果依然不稳定。一会儿效率30%,一会儿60%,偶尔达到70%,下一次又突然掉下来。遇到这种情况继续不停修改参数,往往只会让实验变得更加混乱。如果你正在搜索“电转效率低怎么办”,而且已经尝试过很多参数,可以考虑暂停继续试错,从头按照完整实验链路重新梳理一次。第一阶段:先建立一个稳定对照不要一开始就挑战最困难的样品。如果实验条件允许,可以先使用相对成熟的细胞体系或者已有成功方案验证设备、电转杯...
8-27
不少实验室优化电转条件时,采用的是一种非常典型的方法:第一次效果不好,加一点电压。第二次死亡率太高,又把电压降下来。第三次改变脉冲时间。第四次再增加DNA量。经过十几轮之后,做过很多实验,但仍然说不清楚到底哪一个因素影响最大。这其实也是为什么“电转效率低怎么办”会成为很多科研人员反复遇到的问题。问题不一定出在不会做实验,而是缺少一套系统化的优化方法。第一步:确定你的核心评价指标首先需要明确实验最终想要什么。如果只是暂时表达一个荧光蛋白,可能更加关注短期转染率。如果做CRISP...
8-27
“设备参数已经按照推荐值设置,为什么电转效率还是很低?”这是电转实验中很常见的情况。一些实验人员在遇到问题后,会第一时间怀疑设备或者程序设置。但在实际排查中,经常可以发现:真正的问题发生在按下电转按钮之前。因此讨论电转效率低怎么办,不能只关注电压和脉冲时间,还应该重新检查整个实验准备过程。细胞数量是否准确?电转体系中细胞数量并不是越多越好。假设一个实验方案建议每次使用1×10⁶个细胞,但实际操作中每次细胞数量波动较大,有时只有5×10⁵,有时又达到2×10⁶,那么即使其他参数...
8-27
在查询电转方案时,经常可以看到类似的数据:“转染效率达到70%。”“电转效率超过80%。”“原代细胞实现高效转染。”但真正自己开始实验以后,却可能只得到20%甚至更低的结果。这时候很多人的第一反应是:是不是自己的参数不对?实际上,电转效率低怎么办,首先需要认识一个问题:别人的最佳参数,不一定是你的最佳参数。即使使用相同细胞名称,具体实验条件也可能不同。同一种细胞,并不意味着状态一样例如同样是HEK293细胞,不同实验室的培养条件、代次、培养基、细胞密度、操作习惯都可能存在差异...
8-27
做细胞电转时,很多实验人员都会遇到一个很现实的问题:明明按照已有方案操作,电转结束后检测发现阳性率很低,甚至几乎看不到明显表达。于是第一个想到的办法往往是:是不是电压太低了?要不要继续增加电压?实际上,电转效率低怎么办,并不能简单归结为“电压不够”。电穿孔本质上是利用电脉冲让细胞膜在短时间内形成瞬时孔道,使质粒DNA、RNA、蛋白或者其他分子进入细胞。最终效率受到细胞状态、样品质量、电参数、电转体系、电极状态以及电转后恢复条件等多个因素共同影响。如果没有找到真正的问题,仅仅提...
8-24
实验室准备采购或者更换电转设备时,经常会问:“这台仪器最高能到多少伏?”“能不能做某某细胞?”“有没有现成参数?”这些问题当然重要。但如果实验室真正长期遇到的问题是电转后细胞死亡严重、重复性差、参数难优化,那么单纯比较最高电压,并不能判断一套电转系统是否适合自己的实验。真正值得关注的,是这套设备能不能帮助实验人员把电转过程控制得更加精细。一、为什么单看最高电压意义有限?不同细胞需要的电转条件不同。有些实验需要相对较高的场强和较短脉冲,有些实验则更加依赖温和、可精细调节的脉冲。...
8-24
比“电转后细胞死亡”更让实验人员头疼的,是同一套参数有时候死亡很多,有时候却表现正常。设备没换。参数没换。细胞名称也一样。但实验结果就是不一样。对于长期做细胞转染、基因编辑或者细胞工程实验的团队来说,这类重复性问题往往比单次失败更加影响项目进度。因为单次失败还能重新优化,而重复性差意味着你根本不知道下一批实验是否还能得到相同结果。那么,问题到底出在哪里?一、参数一样,不代表实验条件真的一样实验记录中经常只写:电压、脉冲时间、脉冲次数。看起来每一次实验都是同一个条件。但是实际影...
8-24
在普通细胞系中能够正常工作的电转条件,换到原代细胞、T细胞、NK细胞或者干细胞以后,经常会出现不同的结果。最典型的问题就是:电转后细胞死亡明显增加。有时甚至会出现一种非常尴尬的情况——阳性率看起来不错,但培养一段时间以后,大量细胞死亡,最终真正能够用于后续实验的有效细胞数量并不多。对于珍贵样本来说,这种失败的成本尤其高。为什么这些细胞更难做?一、“难转染”并不只是转染效率低很多人理解的难转染细胞,就是外源物不容易进入。实际上,“难转染”往往还包括另一个问题:细胞对操作过程更加...